ARPACS prowadzi archiwum krótkoterminowe o konfigurowanym okresie przechowywania oraz długoterminowe na różnego rodzaju nośnikach (dyski twarde, dyski CDR, DVD, "Juke Box", biblioteki taśmowe) dając użytkownikowi możliwość wyboru stosownie do potrzeb i możliwości.

System ARPACS jest wyposażony w funkcje automatycznej archiwizacji. Czynność związana z wykonywaniem kopii zapasowych nowych badań obrazowych wykonywana jest automatycznie przez system, który w pierwszej kolejności kompletuje badania po 650MB lub 4.5GB i następnie nagrywa je na płytach CD/DVD (nagrywane są obrazy diagnostyczne, opis badania oraz przeglądarka umożliwiająca obejrzenie obrazów).

Nagrywanie może być w prostszym rozwiązaniu wykonywane przez zainstalowaną na serwerze nagrywarkę CD/DVD. W rozbudowanej konfiguracji proces ten wykonywany jest automatycznie przez roboty nagrywające płyty i drukujące etykietę. Obrazy badań, które zostały zarchiwizowane na nośnikach CD/DVD są automatycznie kasowane przez system.

System automatycznie powiadamia użytkowników systemu w przypadku, gdy stan wolnej pamięci archiwum zbliżył się do minimalnego poziomu.